בדיקה גנטית

ניתוח רצף. רצף של כל 18 האקסונים המקודדים של TCF4 (אקסונים 2 עד 19), צומת אחוי ואזורי איגוף אינטרוניים מיידיים מגלה כ- 70% מהווריאציות הפתוגניות [Whalen et al 2012].

ניתוח מחיקה / שכפול. כ -30% מהגרסאות הפתוגניות של TCF4 הן גידולים שלמים או חלקיים, בגודל משתנה מאקסון יחיד ל ~ 12 Mb [Whalen et al 2012]. מתוכם, לפחות עשרה דוחות מתארים מחיקות של אקסון יחיד או חלקי, שניתן לזהות רק באמצעות ניתוח מחיקה / שכפול (טבלה 1) [Brockschmidt et al 2007, Rosenfeld et al 2009, Lehalle et al 2011, Whalen et al 2012].

ניתוח מיקרו מערך כרומוזום (CMA) (המכונה גם הכלאה גנומית השוואתית מערך [aCGH]) מגלה מחיקה אצל כשליש מהאנשים עם PTHS. הערה: נדרש ניתוח כרומוזומים ברזולוציה גבוהה כדי לקבוע אם טרנסלוקציה קיימת אצל אנשים אלה.

בדיקה ציטוגנטית. מחיקות גלוי ציטוגנטיות או סידורים מחדש של כרומוזומים המשבשים TCF4 אותרו אצל שבעה אנשים לפחות עם PTHS [Gustavsson et al 1999, Giurgea et al 2008, Kalscheuer et al 2008, Kato et al 2010, Marangi et al 2011]. בנוסף, גודלם של מספר המחיקות שזוהו על ידי CMA יהפוך אותם לגלויים ציטוגנטית [Whalen et al 2012].

אסטרטגיית בדיקה

כדי לאשר / לבסס את האבחנה של תסמונת פיט-הופקינס ניתן:

1. מציעים אסטרטגיית רצף מדורגת, המתחילה באקסון 18, המקנה 25% מהגרסאות הפתוגניות; עם זאת, ייתכן שבדיקות כאלה אינן זמינות באופן נרחב.
2. לבצע ניתוח רצף TCF4. הערה: Whalen et al [2012] אם לא נמצא גרסה פתוגנית על ידי ניתוח רצף, בצע ניתוח מחיקה / שכפול ברמת אקסון.
3. אם לא נמצא וריאנט או מחיקה פתוגניים על ידי ניתוח מחיקה / כפילות ונותר חשד קליני חזק ל- PTHS, בצע קריוטיפ כדי לחפש טרנסלוקציה מאוזנת לכאורה הכרוכה באזור 18q21.2 (שלא יגלה בשני הרצפים או בניתוח רצף או CMA).